Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capns2Q9D7J7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms