Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nop56Q9D6Z1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Nop56Q9D6Z1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nop56Q9D6Z1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Nop56Q9D6Z1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nop56Q9D6Z1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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