Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms