Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cmtm5Q9D6G9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms