Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms