Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc39Q9D5Y1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc39Q9D5Y1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms