Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc130Q9D516 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms