Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf6Q9D4J7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms