Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms