Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Trappc6bQ9D289 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Trappc6bQ9D289 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc6bQ9D289 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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