Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bcas2Q9D287 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bcas2Q9D287 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bcas2Q9D287 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bcas2Q9D287 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Bcas2Q9D287 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bcas2Q9D287 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bcas2Q9D287 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bcas2Q9D287 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Bcas2Q9D287 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bcas2Q9D287 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bcas2Q9D287 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Bcas2Q9D287 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Bcas2Q9D287 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bcas2Q9D287 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bcas2Q9D287 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bcas2Q9D287 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bcas2Q9D287 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bcas2Q9D287 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bcas2Q9D287 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bcas2Q9D287 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bcas2Q9D287 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bcas2Q9D287 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bcas2Q9D287 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bcas2Q9D287 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bcas2Q9D287 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms