Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D1F3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D1F3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D1F3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms