Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Q9D131 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Q9D131 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Q9D131 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms