Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem53Q9D0Z3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms