Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc47Q9D024 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc47Q9D024 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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