Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snf8Q9CZ28 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms