Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mis12Q9CY25 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms