Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cnot11Q9CWN7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cnot11Q9CWN7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cnot11Q9CWN7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cnot11Q9CWN7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cnot11Q9CWN7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cnot11Q9CWN7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cnot11Q9CWN7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cnot11Q9CWN7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cnot11Q9CWN7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cnot11Q9CWN7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnot11Q9CWN7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cnot11Q9CWN7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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