Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sycp2Q9CUU3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sycp2Q9CUU3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms