Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sft2d3Q9CSV6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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