Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rprd1bQ9CSU0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms