Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q9CR55 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q9CR55 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q9CR55 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Q9CR55 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q9CR55 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CR55 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q9CR55 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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