Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PompQ9CQT5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms