Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nudt21Q9CQF3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Nudt21Q9CQF3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms