Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Use1Q9CQ56 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Use1Q9CQ56 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Use1Q9CQ56 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Use1Q9CQ56 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Use1Q9CQ56 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Use1Q9CQ56 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Use1Q9CQ56 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Use1Q9CQ56 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Use1Q9CQ56 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Use1Q9CQ56 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Use1Q9CQ56 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Use1Q9CQ56 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Use1Q9CQ56 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Use1Q9CQ56 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Use1Q9CQ56 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Use1Q9CQ56 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Use1Q9CQ56 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Use1Q9CQ56 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Use1Q9CQ56 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Use1Q9CQ56 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Use1Q9CQ56 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Use1Q9CQ56 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Use1Q9CQ56 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Use1Q9CQ56 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Use1Q9CQ56 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Use1Q9CQ56 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Use1Q9CQ56 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Use1Q9CQ56 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Use1Q9CQ56 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Use1Q9CQ56 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Use1Q9CQ56 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Use1Q9CQ56 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Use1Q9CQ56 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Use1Q9CQ56 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Use1Q9CQ56 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Use1Q9CQ56 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Use1Q9CQ56 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Use1Q9CQ56 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Use1Q9CQ56 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Use1Q9CQ56 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Use1Q9CQ56 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Use1Q9CQ56 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Use1Q9CQ56 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Use1Q9CQ56 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Use1Q9CQ56 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Use1Q9CQ56 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Use1Q9CQ56 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Use1Q9CQ56 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Use1Q9CQ56 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Use1Q9CQ56 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms