Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnaseh2cQ9CQ18 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnaseh2cQ9CQ18 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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