Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ8

Cmc1, COX assembly mitochondrial protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc1Q9CPZ8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmc1Q9CPZ8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmc1Q9CPZ8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmc1Q9CPZ8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmc1Q9CPZ8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmc1Q9CPZ8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmc1Q9CPZ8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmc1Q9CPZ8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmc1Q9CPZ8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmc1Q9CPZ8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmc1Q9CPZ8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmc1Q9CPZ8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmc1Q9CPZ8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmc1Q9CPZ8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmc1Q9CPZ8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmc1Q9CPZ8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmc1Q9CPZ8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmc1Q9CPZ8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmc1Q9CPZ8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmc1Q9CPZ8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmc1Q9CPZ8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmc1Q9CPZ8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms