Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc198Q9CPZ1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc198Q9CPZ1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc198Q9CPZ1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms