Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rrbp1Q99PL5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rrbp1Q99PL5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms