Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atoh8Q99NA2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms