Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6dQ99N07 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms