Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprtQ99M80 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PtprtQ99M80 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprtQ99M80 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms