Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rcbtb2Q99LJ7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms