Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf19Q99KP6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf19Q99KP6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf19Q99KP6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf19Q99KP6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf19Q99KP6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf19Q99KP6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf19Q99KP6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf19Q99KP6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf19Q99KP6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms