Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Reep3Q99KK1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms