Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp11Q99K46 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms