Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Def8Q99J78 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Def8Q99J78 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms