Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim11aQ99J19 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Smim11aQ99J19 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Smim11aQ99J19 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim11aQ99J19 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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