Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc8b1Q925Q3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc8b1Q925Q3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms