Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cldn16Q925N4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cldn16Q925N4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms