Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rnf144aQ925F3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rnf144aQ925F3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf144aQ925F3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rnf144aQ925F3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rnf144aQ925F3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rnf144aQ925F3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rnf144aQ925F3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Rnf144aQ925F3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Rnf144aQ925F3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rnf144aQ925F3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rnf144aQ925F3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf144aQ925F3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf144aQ925F3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf144aQ925F3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf144aQ925F3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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