Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim59Q922Y2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim59Q922Y2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms