Protein–RNA interactions for Protein: Q920M7

Syt17, Synaptotagmin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt17Q920M7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Syt17Q920M7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Syt17Q920M7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Syt17Q920M7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Syt17Q920M7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Syt17Q920M7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Syt17Q920M7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syt17Q920M7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms