Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek8Q91ZR4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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