Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tdrd3Q91W18 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tdrd3Q91W18 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms