Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApofQ91V80 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms