Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cabp4Q8VHC5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cabp4Q8VHC5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms