Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
TgdsQ8VDR7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TgdsQ8VDR7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms