Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg10Q8R1P4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg10Q8R1P4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms