Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Lrrtm1Q8K377 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Lrrtm1Q8K377 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Lrrtm1Q8K377 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Lrrtm1Q8K377 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Lrrtm1Q8K377 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lrrtm1Q8K377 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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